Докторантура - II ступень послевузовского образования, направленная на подготовку специалистов, обладающих навыками организации научно-исследовательской работы по новому направлению научных исследований или в развитие существующих актуальных направлений научных исследований, аналитического обобщения результатов научной деятельности, позволяющими подготовить квалификационную научную работу (диссертацию) на соискание ученой степени доктора наук.

В настоящее время в докторантуре университета подготовка научных работников высшей квалификации ведется по 2 специальностям:

03.00.00 Биологические науки

03.01.00 Физико-химическая биология

03.01.04 Биохимия

10.00.00 Филологические науки

10.02.00 Языкознание

10.02.20 Сравнительно-историческое, типологическое и сопоставительное языкознание

Образовательные программы докторантуры реализуются в дневной форме получения образования (не более 3-х лет) либо в форме соискательства (не более 5-ти лет).